Las cámaras temáticas desempeñan un papel importante en las actividades de la Academia Copernicana. Sus nombres y el ámbito de actividad corresponden al perfil de la investigación realizada en el pasado por Nicolás Copérnico, patrón de la Academia Copernicana:
Cámara de Astronomía y de Ciencias Naturales y Matemáticas
Cámara de Ciencias Médicas
Cámara de Ciencias Económicas y de Gestión
Cámara de Filosofía y Teología
Cámara de Ciencias Jurídicas
Cámara de los Laureados del Premio Copernicano
