Das Hauptziel der Hochschule ist die Ausbildung neuer Forscher und die Durchführung von Forschungs- und Entwicklungsarbeiten. Die in Warschau ansässige Hochschule wird die Aktivitäten folgender Fakultäten integrieren:
- Fakultät für Astronomie und Naturwissenschaften in Toruń,
- Fakultät für medizinische Wissenschaften in Olsztyn,
- Fakultät für Wirtschaftswissenschaften und Management in Warschau,
- Fakultät für Philosophie und Theologie in Krakau,
- Fakultät für Rechtswissenschaften in Lublin.
Obwohl die Schule formal eine eigenständige Einheit sein wird, wird sie in die Kopernikanische Akademie integriert sein, und zwar durch die Generalversammlung der Akademie, die die gesetzliche Funktion des Hochschulrats wahrnehmen wird. Darüber hinaus wird die Kopernikanische Akademie Einfluss auf die Besetzung der Organe der Hochschule (einschließlich der Rektoren) nehmen.
Gemäß dem Grundsatz der Autonomie der öffentlichen Hochschuleinrichtungen werden die detaillierten Regelungen für die Durchführung der Aufgaben durch die Hochschule und die einzelnen Fakultäten von der Hochschule selbst in ihrer Satzung festgelegt.
