هدف المدرسة الرئيسي هو إعداد باحثين جُدد. وإجراء البحوث العلمية والأعمال التطويرية. وتقوم المدرسة الموجودة في وارسو بربط نشاطات:

• كلية الفلك والعلوم الطبيعية في مدينة تورون (Toruń)
• كلية العلوم الطبية في مدينة أولشتين (Olsztyn)
  كلية علوم الاقتصاد والإدارة في وارسو
• كلية الفلسفة واللاهوت في مدينة كراكوف (Kraków)
• كلية العلوم الحقوقية في مدينة لوبلين. (Lublin)

المدرسة من الناحية الشكلية هيئة مستقلة ولكنها مرتبطة بأكاديمية كوبرنيكوس وذلك لأن الجمعية العامة للأكاديمية تقوم بوظائفها القانونية كمجلس للجامعة. إضافة لذلك سيكون لأكاديمية كوبرنيكوس نفوذ في تعيين هيئات المدرسة بما فيهم رؤساء المدرسة.
مع الحفاظ على استقلالية الجامعات العامة فإن الحلول التفصيلية المتعلقة بتنفيذ المهمات الموكلة للمدرسة والكليّات ستُقرّ بطريقة مستقلة في النظام الأساسي للمدرسة.